| 島、岩の名称 | 読 み | 所 在 | 緯度 | 分 | 経度 | 分 | 港 | 高 さ | 記事 | 海図№ | 管 轄 |
| 赤石 | あかいし | 八重山郡竹富町 | 24 | 18 | 123 | 41 | 高さ不明 | １２８９ | 石垣保安部 | ||
| 赤離島 | あかばなれしま | 八重山郡竹富町 | 24 | 24 | 123 | 52 | 高さ不明 | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| アガリノソーリ | あがりのそーり | 八重山郡竹富町 | 24 | 20 | 124 | 5 | ７ｍ | １２８５ | 石垣保安部 | ||
| アダン離 | あだんばなれ | 宮古島市伊良部 | 24 | 48 | 125 | 11 | 高さ不明 | １２８３ | 宮古島保安署 | ||
| 新城島 | あらぐすくしま（うえ) | 八重山郡竹富町 | 24 | 14 | 123 | 57 | 上地港 | 有人島 | １２０６ | 石垣保安部 | |
| 新城島 | あらぐすくしま（しも) | 八重山郡竹富町 | 24 | 13 | 123 | 56 | ２１ｍ | 有人島 | １２０６ | 石垣保安部 | |
| 池間島 | いけましま | 宮古島市 | 24 | 56 | 125 | 25 | 池間漁港 | 26m。池間大橋 | 有人島 | １２８１ | 宮古島保安署 |
| 石垣島 | いしがきしま | 石垣市 | 24 | 24 | 124 | 12 | 石垣港 他 | 於茂登山526m | 有人島 | １２０６ | 石垣保安部 |
| 伊良部島 | いらぶしま | 宮古島市伊良部 | 24 | 50 | 125 | 11 | 長山港 他 | 89m | 有人島 | １２８１ | 宮古島保安署 |
| 西表島 | いりおもてしま | 八重山郡竹富町 | 24 | 20 | 123 | 50 | 船浦港 他 | 古見岳（４７０ｍ） | 有人島 | １２０６ | 石垣保安部 |
| イリノソーリ | いりのそーり | 八重山郡竹富町 | 24 | 20 | 124 | 5 | ８．９ｍ | １２８５ | 石垣保安部 | ||
| 魚釣島 | うおつりしま | 石垣市 | 25 | 44 | 123 | 28 | 362m | １２０３ | 石垣保安部 | ||
| 内離島 | うちばなり（ぱくり） | 八重山郡竹富町 | 24 | 21 | 123 | 44 | △１９４ｍ | １４８７ | 石垣保安部 | ||
| ウ離島 | うぱくりしま | 八重山郡竹富町 | 24 | 22 | 123 | 57 | 18m | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| ウビラ石 | うびらいし | 八重山郡竹富町 | 24 | 17 | 123 | 41 | １７ｍ | １２８９ | 石垣保安部 | ||
| 大神島 | おおがみしま | 宮古島市 | 24 | 55 | 125 | 19 | 島尻漁港 | 75m | 有人島 | １２８１ | 宮古島保安署 |
| 大瀬離島 | おおせばなれしま | 石垣市 | 24 | 37 | 124 | 19 | 28m | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| 沖ノ北岩 | おきのきたいわ | 石垣市 | 25 | 48 | 123 | 33 | 27m | １２０３ | 石垣保安部 | ||
| 沖ノ南岩 | おきのみなみいわ | 石垣市 | 25 | 45 | 123 | 34 | ９ｍ | １２０３ | 石垣保安部 | ||
| 嘉弥真島 | かやましま | 八重山郡竹富町 | 24 | 22 | 124 | 0 | １２０６ | 石垣保安部 | |||
| カラス島 | からすしま | 八重山郡竹富町 | 24 | 16 | 123 | 53 | １８ｍ | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| 北小島 | きたこしま | 石垣市 | 25 | 44 | 123 | 33 | 118m | １２０３ | 石垣保安部 | ||
| 来間島 | くりましま | 宮古島市 | 24 | 43 | 125 | 15 | 来間前浜港 | 47m。来間大橋 | 有人島 | １２８１ | 宮古島保安署 |
| 黒島 | くろしま | 八重山郡竹富町 | 26 | 15 | 124 | 1 | 黒島港 | 灯台有り | 有人島 | １２０６ | 石垣保安部 |
| 軍艦石 | ぐんかんいし | 石垣市 | 24 | 21 | 124 | 7 | 石垣港内 | ３．７ｍ | １２８６ | 石垣保安部 | |
| 久場島（黄尾嶼) | くばしま（こうびしょ) | 石垣市 | 25 | 55 | 123 | 41 | 117m | １２０３ | 石垣保安部 | ||
| 小島 | こしま | 石垣市 | 24 | 27 | 124 | 9 | 14m | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| 小浜島 | こばましま | 八重山郡竹富町 | 24 | 20 | 123 | 59 | 小浜港 | 大岳 99m | 有人島 | １２０６ | 石垣保安部 |
| サッチ離 | さっちばなれ | 宮古島市伊良部 | 24 | 48 | 125 | 11 | ８ｍ | １２８３ | 宮古島保安署 | ||
| シカボヤ | しかぼや | 八重山郡竹富町 | 24 | 19 | 123 | 45 | ４ｍ | １２８９ | 石垣保安部 | ||
| 下地島 | しもじしま | 宮古島市伊良部 | 24 | 49 | 125 | 9 | 長山港 | 有人島 | １２８１ | 宮古島保安署 | |
| 大正島（赤尾嶼） | たいしょうしま（せきびしょ | 石垣市 | 25 | 55 | 124 | 34 | 79m | １２０３ | 石垣保安部 | ||
| 外離島 | そとばなり（ぱくり）しま | 八重山郡竹富町 | 24 | 22 | 123 | 43 | △１４９ｍ | ０ | １２８９ | 石垣保安部 | |
| 竹富島 | たけとみしま | 八重山郡竹富町 | 24 | 19 | 124 | 5 | 竹富東港 | △２１ | 有人島 | １２８５ | 石垣保安部 |
| 多良間島 | たらましま | 宮古郡多良間村 | 24 | 39 | 124 | 42 | 普天間港他 | 無線塔117m | 有人島 | １２０５ | 宮古島保安署 |
| 千鳥ノ離レ | ちどりのはなれ | 宮古島市 | 24 | 50 | 125 | 17 | ２．５ｍ | １２８２ | 宮古島保安署 | ||
| 飛瀬 | とびせ | 石垣市 | 25 | 45 | 123 | 30 | １２０３ | 石垣保安部 | |||
| ナーラサノ石 | なーらさのいし | 八重山郡竹富町 | 24 | 19 | 124 | 6 | ２．２ｍ | １２８６ | 石垣保安部 | ||
| 中地ノ離レ | なかじのはなれ | 宮古島市 | 24 | 51 | 125 | 17 | ６．７ｍ | １２８２ | 宮古島保安署 | ||
| 仲ノ御神島 | なかのうがんしま | 八重山郡竹富町 | 24 | 11 | 123 | 34 | 102m | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| 中ノ離レ | なかのはなれ | 宮古島市 | 24 | 51 | 125 | 17 | ９ｍ | １２８２ | 宮古島保安署 | ||
| 仲間青島 | なかまあおしま | 八重山郡竹富町 | 24 | 16 | 123 | 54 | １２ｍ | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| 釜石 | はがまいし | 石垣市 | 24 | 20 | 124 | 10 | ３．８ｍ | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| 波照間島 | はてるましま | 八重山郡竹富町 | 24 | 3 | 123 | 47 | 波照間漁港 | 60m。灯台あり | 有人島 | １２０６ | 石垣保安部 |
| 鳩離島 | はとばなれ（ぱくり）しま | 八重山郡竹富町 | 24 | 25 | 123 | 49 | １０ｍ | １２８８ | 石垣保安部 | ||
| 鳩間島 | はとましま | 八重山郡竹富町 | 24 | 28 | 123 | 49 | 鳩間港 | ４７ｍ（灯台） | ４４ | １２０６ | 石垣保安部 |
| パナレ干瀬 | ぱなれびせ | 宮古島市 | 24 | 43 | 125 | 29 | 8m | １２０５ | 宮古島保安署 | ||
| 未碆 | ひつじばえ | 石垣市 | 24 | 18 | 124 | 7 | １．２ｍ | １２８５ | 石垣保安部 | ||
| 平離島 | ひらばなれしま | 石垣市 | 24 | 29 | 124 | 7 | 石垣島北西岸 | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| 二ツノ離レ | ふたつのはなれ | 宮古島市 | 24 | 51 | 125 | 17 | ７．３ｍ | １２８２ | 宮古島保安署 | ||
| 二つ離岩 | ふたつはなれいわ | 宮古島市伊良部 | 24 | 48 | 125 | 13 | ４．２ｍ | １２８３ | 宮古島保安署 | ||
| フデ岩 | ふでいわ | 宮古島市 | 24 | 59 | 125 | 22 | 9m,Ｌｔ有り | １２０５ | 宮古島保安署 | ||
| マジパナリ | まじぱなり | 石垣市 | 24 | 28 | 124 | 9 | 8.8m | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| ﾏﾙﾏﾎﾞﾝｻﾝ | まるまぼんさん | 八重山郡竹富町 | 24 | 23 | 123 | 45 | １３ｍ | １４８７ | 石垣保安部 | ||
| ミズバナリ岩 | みずばなりいわ | 宮古郡多良間村 | 24 | 38 | 124 | 43 | 高さ不明 | １２０５ | 宮古島保安署 | ||
| 南小島 | みなみこじま | 石垣市 | 25 | 44 | 123 | 33 | 138m | １２０３ | 石垣保安部 | ||
| 宮古島 | みやこしま | 宮古島市 他 | 24 | 47 | 125 | 20 | 平良港 他 | 野原岳109m | 64100 | １２０５ | 宮古島保安署 |
| 水納島 | みんなしま | 宮古郡多良間村 | 24 | 45 | 124 | 42 | 水納港 | 6m | ７ | １２０５ | 宮古島保安署 |
| ムクパナリ | むくぱなり | 石垣市 | 24 | 27 | 124 | 9 | 高さ不明 | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| ユシキ離 | ゆしきばなれ | 八重山郡竹富町 | 24 | 20 | 123 | 41 | １８ｍ | １２８９ | 石垣保安部 | ||
| 由布島 | ゆぶしま | 八重山郡竹富町 | 24 | 20 | 123 | 56 | １４ | １２０６ | 石垣保安部 | ||
| 与那国島 | よなくにしま | 八重山郡与那国町 | 24 | 27 | 123 | 0 | 祖納港 他 | 宇良部岳231m | 1800 | ２２４ | 石垣保安部 |
| ヨナ曽根 | よなそね | 八重山郡竹富町 | 24 | 20 | 123 | 41 | ２．１ｍ | １２８９ | 石垣保安部 |